En mai 2011, en réponse aux allégations de corruption formulées par des représentants nationaux participant à une réunion de l'Union caribéenne de football (CFU) le 10 mai, Blazer a lancé une enquête sur le président de l'AFC Mohammed Bin Hammam et le vice-président de la FIFA, Jack Warner. L'enquête a été menée par John P. Collins, ancien procureur fédéral des États-Unis et membre du Comité juridique de la FIFA. Sa soumission a conduit à la suspension par la FIFA, le 29 mai 2011, de Jack Warner et Bin Hammam de toutes les activités de football, en attendant le résultat de l'enquête et des procédures de la FIFA[10],[11]. Le président par intérim de la CONCACAF, Lisle Austin, a tenté de licencier Chuck Blazer cinq jours plus tard, mais l'action a été bloquée par le comité exécutif de la CONCACAF[12].
Le 14 août 2011, le journaliste Andrew Jennings a rapporté dans le journal britannique The Independent que le FBI examinait des preuves documentaires révélant des paiements confidentiels liés au football vers des comptes offshore gérés par Chuck Blazer[13].
En décembre 2011, Chuck Blazer a commencé à travailler sous couverture pour le FBI[14].
Le 19 avril 2013, Chuck Blazer et Jack Warner ont été accusés de fraude massive au cours de leurs années en tant que dirigeants de la CONCACAF. Un audit médico-légal mené par le Comité d'intégrité de l'organisation a déterminé que les deux hommes avaient fonctionné sans contrat écrit de 1998 jusqu'à leur départ respectif, et que Blazer avait reçu 15 millions de dollars de commissions pour ses services pendant cette période[15]. Une source gouvernementale anonyme s'attendait à ce que l'enquête en cours du FBI sur les finances de Blazer soit considérablement élargie et rejointe par l'IRS[16]. En mai 2013, Blazer a été suspendu pendant 90 jours[17].
Le 27 mai 2015, plusieurs responsables de la FIFA ont été arrêtés à Zurich, Blazer ayant été un témoin clé dans l'enquête qui a conduit aux arrestations[18]. En échange de sa coopération, Blazer a accepté de plaider coupable à des accusations qui incluent le racket, la fraude électronique, l'évasion fiscale et le blanchiment d'argent[19]. Chuck Blazer est décédé avant d'avoir été condamné. Le retard dans le prononcé de la peine a été causé par la décision de ses coaccusés de se présenter au procès[20].
Le 3 juin 2015, la transcription d’une procédure de détermination de la peine à huis clos (qui s’est déroulée devant le tribunal de district américain du district Est de New York le 25 novembre 2013) a été rendue publique. Lors de son témoignage en 2013, Blazer a admis avoir conspiré avec d'autres membres du Comité exécutif de la FIFA pour accepter des pots-de-vin en vue de la sélection des pays hôtes des Coupes du monde de 1998 et 2010.
Le 9 juillet 2015, Blazer a été banni à vie par la FIFA de toute activité liée au football[6].
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