Les anciens bâtiments de la commanderie ont été détruits longtemps avant la Révolution française, mais la commanderie même subsista et conserva son bénéfice curial et eut des titulaires jusqu'en 1791[2].
Près de l'église de Bonnevaux se trouvait l'ancien cimetière de la commanderie, qui était également à l'usage des communes de Jonchery et de Laharmand, et qui servit jusqu'au XVIIesiècle[2].
Seul reste aujourd'hui la ferme de Bonnevaux, écart situé entre Jonchery et Laharmand, sur les bords du ruisseau du même nom.
Commandeurs
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Nicolas Gaillard, cité en 1513 et 1525. À sa mort, il est inhumé en l'église de la commanderie.
Charles-François de Cluny, cité en 1780 et 1783. Il est ensuite commandeur de la commanderie de La Romagne.
Louis-Auguste de la Vallée-Pimodan, cité en 1783 et 1789.
Mérigny, cité en 1789 et 1791. Fidèle et déporté, il demeurait à Chaumont.