Chassés de Blois après l'assassinat du duc de Guise en 1588, les Capucins y reviennent à l'appel de l'archevêque de Lyon en 1596. Ils font alors bâtir une petite église, Sainte-Conception, qui est bénie le .
Dix ans plus tard, l'ancien couvent est racheté par la commune de Blois. À l'exception de son église, transformée en chapelle funéraire, ses bâtiments sont alors détruits et le terrain est transformé en cimetière à partir de 1806. Agrandie en 1838, la nécropole est finalement déménagée au niveau de l'actuel cimetière de Blois-ville en 1857. Les terrains de l'ancien couvent sont alors vendus par la ville de Blois[2]. En 1893, l'église du couvent est démolie, faisant ainsi disparaître toute trace de la présence des Capucins dans le quartier[3].
