Le , alors que Farquhar évolue dans les ligues mineures pour un club-école des Blue Jays, la franchise torontoise le transfère aux Athletics d'Oakland en compagnie d'un autre lanceur droitier, Trystan Magnuson, pour acquérir le voltigeurRajai Davis[2]. Farquhar est cependant rapatrié rapidement par les Jays, qui l'obtiennent des Athletics le dans la transaction qui envoie à Oakland le lanceur gaucher David Purcey[3].
Blue Jays de Toronto
Danny Farquhar fait ses débuts dans le baseball majeur avec Toronto le . Il dispute trois parties avec eux en fin de saison.
En 46 matchs en 2013, Farquhar présente une moyenne de points mérités de 4,20 en 55 manches et deux tiers lancées. Il réussit 79 retraits sur des prises, soit 12,8 par 9 manches lancées. Il remplace Tom Wilhelmsen comme stoppeur des Mariners au début août[5] et réussit 16 sauvetages, le 2eplus haut total après les 24 de Wilhelmsen[6]. Farquhar, dont les 3 décisions en 2013 sont des défaites, réalise son premier sauvetage le sur les Orioles de Baltimore[7].
Farquhar n'est pas de retour comme stoppeur pour Seattle en 2014, les Mariners ayant engagé durant l'hiver le vétéran Fernando Rodney pour remplir ce rôle. Le contre les Rangers du Texas, Farquhar remporte sa première victoire dans les majeures[8].
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