Dickeya
Genre de bactéries
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Dickeya est un genre de bacilles Gram négatifs de la famille des Pectobacteriaceae. Son nom fait référence au phytopathologiste R.S. Dickey en hommage à ses contributions concernant l'étude du « complexe Erwinia chrysanthemi »[1].
Cet article est une ébauche concernant la microbiologie.
Plusieurs espèces sont des phytopathogènes notoires[2],[3].
Taxonomie
Ce genre a été créé en 2005 par reclassement des espèces Pectobacterium chrysanthemi et Brenneria paradisiaca déjà comptées dans la famille des Pectobacteriaceae[1].
Jusqu'en 2016 il était compté parmi les Enterobacteriaceae auquel il était rattaché sur la base de critères phénotypiques. Depuis la refonte de l'ordre des Enterobacterales en 2016 par Adeolu et al. à l'aide des techniques de phylogénétique moléculaire, il a été déplacé vers la famille des Pectobacteriaceae nouvellement créée[4].
Liste d'espèces
Selon la LPSN (26 octobre 2022)[5] :
- Dickeya aquatica Parkinson et al. 2014
- Dickeya chrysanthemi (Burkholder et al. 1953) Samson et al. 2005 – espèce type
- Dickeya dadantii Samson et al. 2005
- Dickeya dianthicola Samson et al. 2005
- Dickeya fangzhongdai Tian et al. 2016
- Dickeya lacustris Hugouvieux-Cotte-Pattat et al. 2019
- Dickeya oryzae Wang et al. 2020
- Dickeya parazeae Hugouvieux-Cotte-Pattat & Van Gijsegem 2021
- Dickeya poaceiphila Hugouvieux-Cotte-Pattat et al. 2020
- Dickeya solani van der Wolf et al. 2014
- Dickeya undicola Oulghazi et al. 2019
- Dickeya zeae Samson et al. 2005
Les espèces suivantes ont été reclassées :
- Dickeya dadantii subsp. dieffenbachiae (Samson et al. 2005) Brady et al. 2012 : reclassement de D. dieffenbachiae
- Musicola paradisiaca (Fernandez-Borrero & Lopez-Duque 1970) Hugouvieux-Cotte-Pattat et al. 2021 : reclassement de D. paradisiaca
Plantes hôtes
Le tableau suivant indique une correspondance entre certaines espèces et leurs plantes hôtes[6],[7] :
| Synonymes | Principales plantes-hôtes | |
|---|---|---|
| Dickeya chrysanthemi bv. chrysanthemi | Erwinia chrysanthemi biotype 5 Erwinia chrysanthemi pv. chrysanthemi Pectobacterium chrysanthemi pv. chrysanthemi | Chrysanthemum spp., pomme de terre, chicorée, tomate, tournesol |
| Dickeya chrysanthemi bv. parthenii | Erwinia chrysanthemi biotype 6 Erwinia chrysanthemi pv. parthenii Pectobacterium chrysanthemi pv. parthenii | Parthenium, artichaut, Philodendron |
| Dickeya dadantii | Erwinia chrysanthemi biotype 3 (certaines souches) | Pelargonium, ananas, pomme de terre, Dianthus spp., Euphorbia, patate douce, bananier, maïs, Philodendron, Saintpaulia |
| Dickeya dianthicola | Erwinia chrysanthemi biotypes 1, 7 et 9 Erwinia chrysanthemi pv. dianthicola Pectobacterium chrysanthemi pv. dianthicola | Dianthus spp., pomme de terre, tomate, chicorée, artichaut, Dahlia, Kalanchoe |
| Dickeya dieffenbachiae | Erwinia chrysanthemi biovar 2 Erwinia chrysanthemi pv. dieffenbachiae Pectobacterium chrysanthemi pv. dieffenbachiae | Dieffenbachia, tomate, bananier |
| Dickeya paradisiaca | Erwinia chrysanthemi biotype 4 Erwinia chrysanthemi pv. paradisiaca Erwinia paradisiaca Brenneria paradisiaca | Bananier, maïs, pomme de terre |
| Dickeya solani | Dickeya spp biotype 3 (certaines souches) | Pomme de terre, jacinthe |
| Dickeya zeae | Erwinia chrysanthemi biotype 8 et autres souches du biotype 3 Pectobacterium chrysanthemi biotype 8 et autres souches du biotype 3 | Maïs, pomme de terre, ananas, bananier, tabac, riz, Brachiaria, Chrysanthemum spp. |
