En , l'armée française de Pichegru franchit le Rhin et envahit les Provinces-Unies. Les patriotes se soulèvent dans tout le pays, le stathouderGuillaume V d'Orange s'exile en Angleterre et la République batave est proclamée. Le , Va Beyma est élu à l'assemblée provisoire de Frise, dont il est élu secrétaire. Comme celle de son frère, son élection à la première Assemblée nationale batave est contestée – notamment par le Frison Dirk Cornelis Kuiken – et il ne devient député qu'en . Fédéraliste très modéré, il est réélu en et il désigné membre de la commission chargée de préparer la nouvelle constitution. Après le coup d'État unitariste du , mené par Pieter Vreede, Van Beyma prête le serment de haine au fédéralisme et au stathouderat. Il est élu député de Dokkum au Corps représentatif batave en . Il quitte l'assemblée un an plus tard, à l'occasion de son renouvellement et rentre en Frise, dont il devient membre du conseil général de 1801 à 1804. Le , il devient député au Corps législatif.
Bibliographie
(nl) P.J. Blok et P.C. Molhuysen, Nieuw Nederlandsch biografisch woordenboek, vol.8, Leyde, A.W. Sijthoff, (lire en ligne), p.101-102