Elizabeth Macgregor est née à Dundee en Écosse. Durant sa jeunesse, elle étudie à l'Université d'Édimbourg où elle obtient une maîtrise en histoire des arts. Elle obtient ensuite un diplôme d'études muséales et de galeries à Manchester[1].
À la fin de ses études, elle rentre au Scottish Arts Council au sein duquel elle occupe le poste de conservatrice et conductrice de la galerie d'art mobile[1]. Elle travaille ensuite pour le Arts Council of Great Britain pendant trois ans, avant devenir directrice de la Ikon Gallery de Birmingham, poste qu'elle occupe pendant dix ans[2].
En 1999, elle est nommée directrice du Musée d'Art contemporain d'Australie (MCA) basé à Sydney[3].
En 2001, elle reçoit la médaille du centenaire pour « service rendu à la société australienne et à l'art contemporain »[4]. Lors de l'anniversaire de la Reine de 2011, Macgregor est nommée officier de l'Ordre de l'Empire britannique dans la liste des services diplomatiques et des pays d'outre-mer pour « service rendu à l'art contemporain »[5]. Elle est également membre de la Royal Society of New South Wales (FRSN)[6].
En 2017, elle est nommée lauréate créative NSW tout comme Carriageworks . Interviewée au sujet de cette récompense, elle déclare : « La créativité est la clé de l'innovation, et l'innovation stimule la croissance, la durabilité et la prospérité, enrichissant le capital culturel de NSW - et de l'Australie »[7].
Toujours en 2016, Macgregor est élue présidente du conseil d'administration du Comité international des musées et collections d'art moderne pour un mandat de trois ans[8].
Elle contribue à la rédaction du chapitre « Investissement dans la culture: la folie ou la nécessité ? » dans une publication de 2006 intitulée Talking About Sydney: Population, community and culture in Contemporary Sydney, édité par Robert Freestone, Bill Randolph et Caroline Butler-Bowdon[9]. Elle contribue aussi à la préface des livres d'artistes et des expositions produits par le MCA. Elle a enfin contribué un essai intitulé A Tale of Two Cultures[2].
Dans sa carrière professionnelle, Macgregor a établi des relations étroites avec l'institution artistique Tate de Londres, favorisant l'acquisition conjointe d'œuvres par 15 artistes australiens[10].
Sa contribution à la scène artistique australienne a valu à Macgregor d'être nommée par l'Australian Financial Review dans la catégorie Arts, Culture et Sport des 100 femmes les plus influentes en 2019[10].