Emmanuel-François de Bausset-Roquefort est issu d'une famille originaire d'Aubagne en Provence . Il est le fils de Michel-Jean-Baptiste de Bausset (mort en 1757), marquis de Roquefort, et de Thérèse Marie de Gantel-Guitton (mort en 1772), et le neveu de Joseph-Bruno de Bausset de Roquefort , évêque de Béziers .
Chanoine , camérier puis vicaire général de son oncle dans le diocèse de Béziers , abbé commendataire de l'abbaye cistercienne de Flaran , il est également l'oncle du futur évêque de Vannes Pierre-Ferdinand de Bausset-Roquefort qui émigre avec lui[ 1] .
Agent général du clergé de France en 1764 en remplacement de Antoine-Éléonor-Léon Leclerc de Juigné , promu à l'évêché de Châlons , il est secrétaire de l'Assemblée du clergé de 1765-1766. Il est désigné comme évêque de Fréjus après la fin de son mandat en 1766, confirmé le 6 août et consacré le 31 du même mois par Christophe de Beaumont du Repaire , l'archevêque de Paris dans l'église Saint-Roch de Paris en même temps que l'évêque d'Avranches , Joseph François de Malide et l'évêque de Saint-Brieuc , François Bareau de Girac . À Fréjus il fait assainir les marais de l'ancien port romain et rebâtir le séminaire . Il dote son diocèse d'un nouveau catéchisme et d'un bréviaire [ 2] . Il est abbé de l'abbaye de Flaran de 1767 à 1790.
Lors de la promulgation de la Constitution civile du clergé , il refuse le serment et émigre d'abord à Nice dans les États de Savoie . Il se retire ensuite à Ferrare puis à Venise . Après la signature du concordat de 1801 , il est un des premiers évêques à se démettre et il meurt le 10 février 1802 à Rijeka (italien : Fiume ) dans l'actuelle Croatie [ 3] .