Elle poursuit ses études après son mariage, obtenant un master et un doctorat[2]. Elle indique avoir suivi son premier cours deux jours après avoir donné naissance à son deuxième enfant. Elle devient la première femme iranienne à obtenir un doctorat en aéronautique[1],[3].
Membre du conseil d'administration d'Iran Air et directrice du département de recherche de l'entreprise[6], elle en devient la PDG le [4]; elle est ainsi la première femme iranienne à accéder à ce poste[7].
En , Farzaneh Sharafbafi se rend à Paris pour participer à la première visite en France depuis plus de 50 ans d'une délégation de femmes d'affaires iraniennes, organisée à l'initiative du Centre franco-iranien. À cette occasion elle a été l'invitée d'honneur d'une réunion avec des représentants d'entreprises françaises au MEDEF. La première interview de Farzaneh Shafbafi avec un média français a été réalisée à la même occasion avec Le Point[réf.nécessaire].
En , Touraj Zanganeh lui succède comme PDG d'Iran Air[8].
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