Un grand nombre de militants libéraux Équatoriens et d'Amérique latine en général haïssaient depuis longtemps García Moreno ; sa troisième élection en 1875, peu avant son assassinat, fut considérée comme son arrêt de mort. Avant de réussir le , Faustino Rayo et ses camarades avaient déjà tenté à plusieurs reprises d'assassiner García Moreno. Après sa troisième victoire consécutive, García Moreno écrivit immédiatement au pape Pie IX pour lui demander sa bénédiction avant son investiture le :
Je désire obtenir votre bénédiction avant ce jour, afin d'acquérir la force et la lumière dont j'ai tant besoin pour être jusqu'au bout un fils fidèle de notre Rédempteur et un serviteur loyal et obéissant de son infaillible Vicaire. Maintenant que les Loges maçonniques des pays voisins, incitées par l'Allemagne, vomissent contre moi toutes sortes d'insultes atroces et d'horribles calomnies, maintenant que ces Loges préparent secrètement mon assassinat, j'ai plus que jamais besoin de la protection divine pour vivre et mourir en défendant notre sainte religion et la chère république que je suis appelé à gouverner à nouveau.
Faustino Rayo et ses camarades assassinent Garcia Moreno à la sortie de la cathédrale de Quito, à coups de couteau et de revolver. Rayo est le chef des assassins, agresse de président de six ou sept coups de machette, et ses trois conspirateurs firent feu[1].
Blanca Muratorio, The Life and Times of Grandfather Alonso, Culture and History in the Upper Amazon, Rutgers University Press, , 81–83p. (ISBN9780813516851, lire en ligne)