Fonte des semis
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Cet article est une ébauche concernant la microbiologie.
La fonte des semis, appelée aussi « pourriture basale[1] », est une maladie des plantes transmise par le sol dont un des principaux symptômes est un pourrissement des semences ou des jeunes pousses en cours de germination.
On peut distinguer deux types de fonte des semis : la fonte de préémergence ou prélevée due à une attaque précoce par des champignons phytopathogènes, souvent présents dans les semences, et qui se traduit par un manque à la levée ; la fonte de postémergence ou postlevée qui résulte d'une altération de la plantule au niveau du collet ou de la radicule. Elle entraîne une perte de rigidité de la plantule qui provoque son affaissement, puis son flétrissement et son dessèchement[2]. Dans une parcelle, la maladie apparait souvent en foyer, l'agent pathogène se propageant d'une plante à l'autre.
De nombreuses espèces de microorganismes phytopathogènes peuvent causer la maladie. Ils appartiennent notamment aux genres suivants de champignons : Botrytis, Fusarium, Rhizoctonia, Sclerotinia, Phoma, ou pseudo-champignons oomycètes : Phytophthora, Pythium. Ce dernier est le plus commun et le plus redouté.
La maladie est considérée comme cryptogamique même si tous les microorganismes concernés ne sont pas des champignons à proprement parler.
Différents symptômes sont associés à la fonte des semis, reflétant la variété des organismes phytopathogènes qui peuvent causer la maladie. Cependant, tous les symptômes entraînent la mort d'un certain nombre de plantules dans une population donnée[3].
En cas d'infection par des espèces de Pythium, les tiges et les racines des plantules sont noires et pourries. Souvent, tout le système racinaire devient mou et la racine externe se détache[4].
Des groupes de plantules peuvent mourir en taches à peu près circulaires, les plantules présentant parfois des lésions de la tige au niveau du sol. Les tiges des semis peuvent également devenir minces et dures (« tige en fil de fer »), ce qui réduit la vigueur des semis. Des taches foliaires accompagnent parfois d'autres symptômes, tout comme une croissance de moisissure grise sur les tiges et les feuilles. Les racines pourrissent parfois complètement ou sont simplement décolorées[3].
Plantes-hôtes
La fonte des semis peut affecter la plupart des cultures, qu'il s'agisse de grandes cultures, notamment céréalières, de cultures fruitières et légumières ou de plantes ornementales[5].
