Il commence sa carrière au King's College de Londres avant d'être nommé à la chaire Kirby Laing d’exégèse du Nouveau Testament à l'Université d'Aberdeen en 1999. En 2007, il prend ses fonctions actuelles de professeur au Département de théologie et de religion de l'Université de Durham[1].
Il est bien connu comme un critique de ce que l’on appelle Nouvelle Perspective sur Paul (NPP). Ses critiques concernant cette NPP ont acquis d'autant plus d’importance qu'il a reçu l’approbation de James Dunn (un des promoteurs de la NPP) pour son sujet de thèse. Après cette dernière approbation, il étudie en particulier le travail socio-scientifique de Klaus Berger, ce qui contribue à le faire changer d’avis de façon spectaculaire sur certains résultats de sa thèse qu’il n’avait pas encore publiée. Le résultat en a été Paul, Judaism, and the Gentiles: A Sociological Approach, où il raconte son changement d'opinion[2].
Le volume qu’il publie en 2013, Gospel Writing. A Canonical Approach, est à ce jour son étude la plus volumineuse. Parmi les articles critiques les plus importants, on relève ceux de Markus Bockmuehl et de Richard Bauckham.
Ted Dorman suggère que, pour Watson, « la souveraineté herméneutique ne réside pas dans le texte, mais dans le sujet auquel il se réfère » - à savoir Jésus-Christ[3].
Watson est rédacteur en chef des New Testament Studies[4].
