Malvoyant de naissance, Javier Aguilar pratique dans un premier temps la natation pendant 12 ans, participant à des compétitions internationales dont les Jeux paralympiques de Sydney[1].
Il commence l’escalade, à 30 ans[2], en extérieur sur les montagnes de la région de Murcie et concourt progressivement au niveau local (championnats d’Espagne en 2015) puis international[1]. Aguilar Amoedo remporte le classement général de la coupe du monde de handi-escalade en 2017, puis une médaille de bronze aux championnats du monde en 2018[1], et devient vice-champion du monde en 2019 à Briançon[2]. Il décroche à nouveau la médaille d’argent en 2023 à Berne[3].
En 2020, il grimpe une voie côtée 7c dans la région de Grenade[2].
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