François Le Fer est le fils de l'armateur Luc Le Fer du Val (1638-1705), maire de Saint-Malo, et de dame Françoise Cochin de La Bellière. Il est le beau frère et homonyme de François Le Fer du Pin capitaine corsaire et armateur.
Il est anobli en 1711 par achat d'une charge de conseiller du roi à la Cour des aides de Clermont. Élu Maire de Saint-Malo en 1731 et exerce cette fonction jusqu'à sa mort.
Le il épouse à Saint-Malo Marie-Françoise Nouail du Fougeray (1676-1736), fille de Jacques Nouail du Fougeray, armateur et négociant à Cadix, et de Françoise Cheville de Vaulerault. Il est le beau-père de l'intendant François de Baussan.
André LespagnolMessieurs de Saint Malo: une élite négociante au temps de Louis XIV Presses Universitaires de Rennes (1997) deux Tomes (ISBN2 86 847229 X) p.854
Gilbert Buti, Philippe Hrodej (dir.), Dictionnaire des corsaires et pirates, CNRS éditions, 2013