François Marguerie est baptisé le dans la paroisse St-Vincent de Rouen, Normandie, France. Il devient explorateur et truchement (interprète), arrivé en Nouvelle-France possiblement avant 1629. Il épouse à Québec le à l'âge de 33 ans, Louise Cloutier, âgée de 13 ans et fille de Zacharie Cloutier et de Xainte Dupont.
François Marguerie passe l'hiver 1635-1636 avec les Algonquins de l'Île aux Allumettes. Il est surnommé par ceux-ci homme double car "il est l'homme blanc le mieux adapté à leurs coutumes et à leurs idiomes".
En , il est capturé par les Iroquois en compagnie de Thomas Godefroy et relâché après plusieurs mois.
Il est décédé par noyade lorsque son canot se renverse le en face de Trois-Rivières en compagnie de son ami Jean Amiot.