En 1990, Gert Van Brabant devient champion provincial du Limbourg. Deux ans plus tard, il remporte l'épreuve Bruxelles-Zepperen ainsi que le Tour de Namur. Il gagne ensuite le Tour du Limbourg amateurs, le Mémorial Philippe Van Coningsloo et deux étapes du Tour de Belgique amateurs en 1993[3].
Après ses performances, il évolue au niveau professionnel entre 1994 et 1996 au sein des équipes Vlaanderen 2002 puis RDM Vosschemie-Zetelhallen[2]. Durant cette période, il obtient quelques victoires et diverses places d'honneur dans des kermesses belges[3]. Il termine notamment huitième d'une édition de Kuurne-Bruxelles-Kuurne.