Il a étudié la médecine et la chirurgie à Strasbourg et à Paris. En 1822, il devient médecin généraliste à Guebwiller et à partir de 1833, il a vécu et travaillé à Mühlhausen[1],[2]. Il fut membre fondateur de la Société médicale du Haut-Rhin[3].
Au cours de sa carrière, il a collaboré avec Jean-Baptiste Mougeot, un botaniste connu pour ses investigations sur la flore des Vosges. On se souvient de lui pour ses recherches sur la flore cryptogamique suisse ; en 1839, il accompagna Philipp Bruch et Guillaume Philippe Schimper lors d'une excursion botanique dans les Alpes et, en 1844, se rendit dans le canton des Grisons[1].
En 1841, le genre Muehlenbeckia a été nommé en son honneur par le botaniste suisse Carl Meissner[4]. En outre, les taxons ayant l'épithète spécifique de muehlenbeckii sont nommés d'après son nom. Exemples[5],[6] :
- Bryum muehlenbeckii, bryum à feuilles concaves (« fil mousse de Muehlenbeck »)
- Dicranum muehlenbeckii, dicrane laineux,
- Grimmia muehlenbeckii, grimmie à deux crêtes.