Hluboká se trouve à 6 km à l'est du centre de Skuteč, à 23 km au sud-est de Chrudim, à 30 km au sud-est de Pardubice et à 120 km à l'est-sud-est de Prague[4].
La commune est limitée par Luže au nord, par Leština au nord-est, par Zderaz au sud-est, par Perálec au sud et par Skuteč à l'ouest[5].