Le territoire qu'occupe Huimilpan est peuplé par un grand nombre de cultures, dont la plus importante est celle des Otomis, qui a laissé son empreinte et dont on trouve encore aujourd'hui des habitants présentant les caractéristiques de cette culture[1].
Au nom de la Couronne espagnole, Montañes participe également à la conquête d'Acámbaro en 1526, puis à celles de San Juan del Río et de Querétaro en 1531[2].
Dès l'époque coloniale, dix haciendas sont fondées sur l'ensemble du territoire, qui ont joué un rôle moteur dans l'économie de cette période, parmi lesquelles: Los Cués, Santa Teresa, Lagunillas, Ceja de Bravo, El Vegil, Apapátaro, La Noria, Carranza, El Milagro et celle des Indiens, qui appartenait au village de Huimilpan et était située à La Trasquila, à 1,5 km du chef-lieu, là où le village est fondé[3].
Le , la Constitution politique de l'État est réformée afin de diviser son territoire en 18 municipalités, faisant d'Himilpan une commune à part entière; pendant une grande partie de son histoire, ses territoires avaient fait partie de la municipalité d'Amealco[4].
↑(es) «Querétaro descubre Huimilpan», Poder Ejecutivo del Estado de Querétaro (consulté le ), «En la época Colonial se instalaron diez haciendas a lo largo del territorio».
↑(es) Evolución histórica de los municipios de México de 1810 a 2020. Querétaro, Instituto Nacional de Estadística y Geografía (México), (lire en ligne[PDF]), p.76.
