Humbert est le fils de Manassès (II/V), seigneur de Cologny, et d'Adélaïde de Savoie-Maurienne, fille du comte Amédée II de Savoie-Maurienne[1]. Il est ainsi le neveu du côté de sa mère du comte Humbert III de Savoie, dont il porte le nom[2],[1].
Il approuve la confirmation consentie par sa mère, en l'an 1090, des donations jadis faites par son père Manassès au prieuré de Nantua ()[1]. Vers 1090, il donne à l’abbaye d’Ambronay une grande étendue de terre dans le territoire de Leyment. En 1107, il fut présent, avec Ponce de Cuiseaux et Fromond de Dramelay, à une donation faite à Cluny par Guillaume comte de Mâcon[1]. En 1116, il donne aux religieux de la chartreuse de Portes, tout ce qu’il possédait dans le territoire de Portes[1].
En 1131, il fait construire l'abbaye du Miroir[1], ordre de Cîteaux, du consentement de sa femme et de ses fils Guerric, Guillaume et Humbert (filiorum suorum Guerrici, Willelmi, Humberti)[1], et donne aux religieux toute la terre qu’il possédait en ce lieu ainsi que le bois contigu nommé Bili ; il leur donne de plus le droit de pacage de par toute sa terre, l’usage de ses forêts, une terre près de Gisia, ainsi que la terre de Lésigna et une colonge à Noms.
Il fait de plus des dons au prieuré de Grand-Bois, sis à Marboz.
Humbert de Coligny meurt au plus tôt en 1131[1]. Son corps est inhummé dans l'abbaye du Miroir, qu'il a fait édifier[1]
