Jakub Kornfeil commence à courir en compétition supermotard dès l'âge de huit ans, remportant le championnat 65 cm3 en 2002. S'ensuivent des championnats au niveau national et européen en catégorie minibike, avant de concourir dans la Red Bull MotoGP Rookies Cup en 2008.
Jakub Kornfeil termine huit des dix courses de la saison dans les dix premières places, en terminant neuvième au classement général, ex æquo avec Daniel Ruiz. Sa deuxième saison dans le championnat a été plus réussie, terminant dans les huit premiers à chaque course, avec trois victoires dans les quatre dernières courses lui permettant de gagner ce championnat devançant Sturla Fagerhaug pour seulement deux points.
Jakub Kornfeil passe en motoGP catégorie 125 cm3, faisant cinq apparitions vers la fin de la saison avec l'équipe Loncin, en remplacement d'Alexis Masbou. Il termine quatre des courses avec un meilleur résultat de 19e au Grand prix de Malaisie.
Jakub Kornfeil et Tomoyoshi Koyama réalise une saison complète en 2010 toujours avec l'équipe Loncin. Bien que Koyama a surclassé son beaucoup moins expérimenté coéquipier, Kornfeil amasse 28 points sur neuf courses pour finir 17e au classement final du championnat. Son meilleur résultat dans la saison a été une cinquième place à son Grand Prix national qui a eu lieu dans des conditions humides.
Les résultats de la saison 2011 lui permet d'accumuler 72 points pour finir 12e au classement final du championnat.
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