Hoffman est ordonné prêtre du diocèse de Toledo par l'évêque George John Rehring(en) le [2]. À la suite de cela, Hoffman devient vicaire de la paroisse Saint-Pierre de Mansfield, de la paroisse Saint-Joseph de Marblehead, ainsi que de la paroisse du Saint-Sacrement de Toledo[1].
En 1966, Hoffman obtient une licence en droit canonique de l'Université catholique d'Amérique située à Washington[1]. Plus tard, Hoffman est nommé secrétaire de l'évêque John Anthony Donovan ainsi que recteur du diocèse[1]. De plus, il est également prêtre de la paroisse Saint-Joseph de Sylnavia.
Hoffman est critiqué concernant sa gestion des abus sexuels sur mineurs dans le diocèse, ce dernier ayant 11 actions en justice intentées contre lui. En 1992, Hoffman place le révérend Robert J. Fisher dans un ministère actif après que celui-ci a déclaré avoir sexuellement agressé une jeune fille âgée de quatorze ans, et passe une trentaine de jours en prison[4]. Par la suite, Hoffman suspend Fisher en 2002 en raison du «climat médiatique», mais déclare qu'il ne prévoit pas d'exclure d'autres prêtres[4]. Il s'exprimera: «Ma difficulté avec la tolérance zéro est que l'Évangile enseigne la réconciliation. Nous croyons au pardon[4].»
James Hoffman succombe à un cancer au Centre des Ursulines de Toledo le , à l'âge de 70 ans[5]. Il est enterré au Cimetière Sainte-Anne de Fremont[5].