Démonstrateur en anatomie et en chirurgie depuis 1745 au cabinet du roi (situé dans le Jardin royal des plantes médicinales), son oncle Antoine Mertrud obtient que son neveu Jean-Claude lui soit adjoint en 1765 pour les démonstrations sur le corps humain. Ils sont tous deux membres de l'Académie de chirurgie. Mertrud le Neveu continue de faire les démonstrations tandis qu'il travaille en même temps, avec Louis Jean-Marie Daubenton, à la dissection de la plupart des quadrupèdes décrits par celui-ci dans l’Histoire naturelle de Buffon[1].
La dépouille du Rhinocéros de Louis XV a été disséquée et naturalisée en , au tout jeune Muséum national d'histoire naturelle, par Jean-Claude Mertrud et Félix Vicq d'Azyr[2].
Jean-Claude Mertrud a été marié avec Marthe Françoise Biberon.
Durant sa carrière au Muséum, son fils Antoine-Louis-François Mertrud assure les fonctions de démonstrateur en anatomie et chirurgie.
↑A. L. de Jussieu, Sixième Notice historique sur le Muséum, Annales du Muséum d'histoire naturelle, Tome Onzième, Tourneisen Fils libraire, Paris, 1808, p.1-39.