De 1991 à 2000 il est Chargé de Recherches au CNRS. Depuis 2000, il est professeur[3] d'informatique à l'Université de Rennes I et de 2012 à 2020[1] Directeur de l'IRISA (UMR CNRS 6074), rattaché à cette université.
Lors de son mandat de directeur de l'IRISA, Jean-Marc Jézéquel a joué un rôle déterminant dans la structuration de la recherche en cybersécurité au sein du Pôle d'excellence Cyber en Bretagne[4],[5].
Il a reçu en 2016 la médaille d'argent du CNRS[4],[6].
Les travaux de cet informaticien ont eu une influence considérable dans le développement des sciences du logiciel, notamment en matière d’ingénierie dirigée par les modèles[6]. En 2020, il obtient le 'career award' de la conférence Model Driven Engineering Languages and Systems , qui récompense ses contributions scientifiques de longue date dans la communauté MDE et son activité exemplaire pour les membres plus jeunes de la communauté MODELS.
