Après avoir suivi des études de lettres à l'Université de Genève, il devient journaliste en 1968 à la fois au Journal de Nyon, pour la revue trilingue "Jeunesse" ainsi qu'à la Télévision suisse romande pour une émission d'été, La Suisse en vacances. En 1970, il est engagé à la Télévision suisse romande[1] et, de 1981 à 1986, il est codirecteur de l'émission Temps présent. Il crée et anime entre 1987 et 1992 le TJ Midi et présente le téléjournal du soir entre 1993 et 1996. À partir de 1996, il anime, produit et dirige l'émission Zig Zag Café jusqu'à sa retraite de la télévision en 2006.
En 2005, il a créé les sociétés Pushkar Productions Sàrl et Espace Jean-Philippe Rapp SA.[réf.nécessaire]
En 2013, il devient président du nouvel orchestre de chambre de Genève, le Geneva Camerata, fondé par le chef d'orchestre David Greilsammer et Céline Meyer[4].
Depuis , il produit et présente l'émission coDDoc sur BeCuriousTV consacrée aux documentaires.
Jean-Philippe Rapp est père de deux enfants, Elise et Julien.