Ses parents se séparent peu après sa naissance sans que leur mariage soit dissous[1].
Le , son père meurt à Besançon à l'âge de 32 ans. Jeanne lui succède comme comtesse de Bourgogne à l'âge de 9 ans[2].
Elle meurt à l'âge de 14 ans en 1205. Sa sœur Béatrice lui succède avec son époux, le duc Othon d'Andechs et de Méranie, qui devient également par mariage le comte OthonII de Bourgogne.
Cependant, certains historiens, en se fondant sur la chronique d'Aubry de Trois-Fontaines et sur des chartes ne mentionnant qu'une fille, estiment que Jeanne et Béatrice sont la même personne, qui a changé de prénom lors de son mariage et repris le prénom de sa grand-mère BéatriceIre de Bourgogne[1],[3].
Références
12Jean-Yves Mariotte, «Othon "Sans Terre", comte palatin de Bourgogne et la fin des Staufen en Franche-Comté», dans Francia. Forschungen zur westeuropäischen Geschichte, 1986, vol. 14, p. 83-102.