De 1990 à 1999, il dirige la maison d'édition Sígueme (Suivez-moi) à Salamanque. De 2000 à 2002, il est vice-directeur du collège pontifical espagnol(es) de Rome. De 2002 à 2014, il est secrétaire général et de 2008 à 2014 également directeur adjoint de sa communauté sacerdotale.
De 2013 à 2015, il est également membre du personnel de la Section des affaires générales du secrétariat d'État du Saint-Siège. De 2014 à 2015, il est nommé vice-recteur du Collège vénézuélien de Rome puis directeur adjoint du Grand Séminaire San Carlos et San Ambrosio de La Havane, à Cuba, jusqu'en 2016.
Depuis 2016, il travaille comme directeur de la Conférence épiscopale espagnole[1] et depuis 2017 également comme secrétaire technique de la Commission épiscopale pour la doctrine de la foi[2].