Murphy retourne aux États-Unis où il devient le directeur d'UFR des arts libéraux de l'Université Marquette, poste qu'il occupe de 1910 à 1921, puis professeur de philosophie à l'Université de Saint-Louis pendant deux ans. Il demande une réaffectation à la mission jésuite et est nommé, à l'âge de 66 ans, vicaire apostolique au Honduras britannique et évêque titulaire de Birtha(de). Le , Murphy est consacré évêque par l'archevêque John Joseph Glennon avec comme co-consécrateurs Anthony J. Schuler et Joseph Chartrand(en). Il dirige la paroisse Saint-Sauveur, l'église mère de Belize. Son épiscopat est marqué par la construction de projets tel que la Cathédrale Saint-Sauveur, la plus grande de Belize à l'époque, ainsi que par la reconstruction suite à l'ouragan survenu en 1931 au Honduras britannique, un ouragan de catégorie 4 ayant tué approximativement 2 500 personnes[1].
Catholique irlandais
Murphy transporté dans un village MayaLa parade du Jubilé de Murphy à Belize
Né au bord de l'Irlande catholique, le zèle de Murphy pour le catholicisme est profondément enraciné dans le catholicisme irlandais ainsi que les relations entre l'Irlande et le Royaume-Uni. Il refuse de se lever pendant l'hymne national britannique lors des cérémonies publiques, ou bien de recevoir l'évêque anglican pour une visite[1]. Murphy semble apprécier le rituel de sa fonction. Il fait une entrée royale au sein des villages Qʼeqchiʼ, transporté sur un trône que les Mayas portaient sur leurs épaules ainsi que des feuilles de palmier et des banderoles agitées autour de lui[2]. Pour son jubilé en tant que prêtre, Belize City lui offre une parade royale. Son asthme cardiaque l'oblige à démissionner à l'âge de 80 ans. Il meurt dans son sommeil le , à Milwaukee[3].
12(en) Charles M. Woods, Joseph Alexander Bennett et Silvaana Udz, Years of Grace: The History of Roman Catholic Evangelization in Belize: 1524-2014 [«Années de grâce : l'histoire de l'évangélisation catholique romaine au Belize : 1524-2014»], Diocèse de Belize City-Belmopan, , 384p. (ISBN978-9-768-19790-0).
↑(en) «Bishop Murphy, SJ, welcomed in state by Keckchi Indians, British Honduras» [«L'évêque Murphy, SJ, accueilli dans l'État par les Indiens Kekchi, au Honduras britannique»], Jesuit Missions,.
