Son livre Nuremberg: Infamy on Trial raconte l'histoire des procès de Nuremberg; il est adapté pour la télévision sous la forme du docudrame Nuremberg.
En 1977, après la fin du mandat de Rockefeller, Persico publie My Enemy My Brother: Men and Days of Gettysburg, un ouvrage historique de non-fiction couvrant la guerre de Sécession. En 1979, il publie un roman, The Spiderweb, et une autre étude de non-fiction, Piercing the Reich: The Penetration of Nazi Germany by American Secret Agents during World War II.
Trois ans plus tard, il produit The Imperial Rockefeller, une biographie de son ancien employeur. Elle est suivie d'une biographie d'Edward R. Murrow. En 1995, il co-écrit l'autobiographie de Colin Powell, My American Journey. Tout au long des années 1990, Joseph Persico continue à publier des livres historiques (Casey: De l'OSS à la CIA et Nuremberg: Infamy on Trial) ainsi que de nombreux articles sur l'histoire américaine.
En , il publie Roosevelt's Secret War: FDR and World War II Espionage et en 2004, Onzième mois, onzième jour, onzième heure: jour de l'armistice, 1918, la Première Guerre mondiale et son violent climax[1]. En , il publie son dernier livre, Roosevelt's Centurions, chez Random House.