Après avoir amorcé la campagne suivante en ligue mineure[2], Thole rejoint les Mets en juin et demeure avec le club new-yorkais jusqu'à la fin de la saison 2010. Il participe à 73 rencontres, frappant pour ,277 avec trois coups de circuit et 17 points produits. Le , il claque aux dépens de Barry Enright des Diamondbacks de l'Arizona son premier circuit en carrière[3].
Receveur le plus utilisé des Mets en 2011, Thole frappe pour ,268 avec 3 circuits et 40 points produits en 114 matchs.
En 2012, Thole dispute 104 parties et frappe pour ,234 avec un circuit et 21 points produits.