Drafté une seconde fois en 2006, devenant un choix de 15etour des Cardinals de Saint-Louis[4], le jeune joueur de deuxième but choisit une fois de plus de poursuivre ses études, cette fois à l'Université Lee de Cleveland, dans le Tennessee.
Zawadzki est éventuellement drafté en 2007 par les Padres de San Diego, qui en font leur sélection de 4eronde[5]. Le , il est rappelé par les Padres pour remplacer dans l'alignement Everth Cabrera, qui vient d'être placé sur la liste des joueurs blessés. Il joue son premier match le à San Diego face aux Brewers de Milwaukee et obtient son premier coup sûr dans les grandes ligues aux dépens du lanceurRandy Wolf.