Elle travaille aux trois premiers degrés de la maçonnerie symbolique du Rite écossais ancien et accepté (REAA) pour ses loges bleues et aux trente autres degrés du REAA pour les ateliers supérieurs, assurant ainsi la continuité initiatique du rite.
De 1923 à 1926, sous la direction d'Adelaide Cabete, vénérable maître de la Loge Humanidade et déléguée du Suprême Conseil, se forment cinq loges (dont «Fiat Lux» à Lisbonne et «Trindade Leitão» à Alcobaça) et au moins un triangle (il manque des données sur un triangle à Portalegre et un autre à Beja)[1]. La Juridiction portugaise est créée et Adelaide Cabete en devient présidente[2].
En 1980, à l'initiative de Jacqueline et René Aucouturier, initiés à Mont-de-Marsan, une nouvelle loge Humanidade, en hommage à celle créée en 1923, est créée à Lisbonne[1]. La loge est rattachée à la Juridiction ibérique[1].
La loge Fraternidade est créée en 1983 à Porto et la loge Athanor en 1984 à Lisbonne, toujours au sein de la Juridiction ibérique[1].
En 1993, sont constitués le Souverain chapitre (du 15e au 18edegré du REAA) A Rosa Lusitana et en 1995 le Sublime aréopage (du 19e au 30edegré du REAA) O Porto do Graal[1].
En 1998, Jorge Gomes est nommé nouveau délégué de la juridiction par le Suprême conseil[1].
En 2000, la loge Liberalitas est créée à Évora. En 2002, c'est la loge União qui est créée à Alcobaça. En 2003, la loge Gaia est créée à Vila Nova de Gaia, la loge Adelaide Cabete à Braga et la loge de perfection (du 4e au 14edegré du REAA) Sete Colinas à Lisbonne[1].
C'est au cours du convent internationale de Paris, en 2007, qu'est acceptée le principe de la constitution de la fédération portugaise.
Le , le siège de l'ordre, au centre de Lisbonne, constitué de deux temples, est inauguré. Le même jour, la charte définitive est reçue et la Fédération portugaise est officiellement instituée[1].
Depuis 2007
Lors de la cérémonie de son premier anniversaire, le , deux traités d'amitié sont signés avec le Grand Orient lusitanien et la Grande Loge féminine du Portugal, rejoignant les trois plus anciennes obédiences libérales et adogmatiques au Portugal.
En 2011, la loge Estrela da Manhâ est créée à Aveiro.