Gomes est directeur du collège Saint-Pierre de Taltola (Calcutta) et curé de la plus importante paroissebengalie de la ville de Calcutta, Sainte-Thérèse, lorsqu’il est choisi pour être le premier évêque du diocèse nouvellement créé de Baruipur(en) (1977), au sud de Calcutta. Le diocèse couvre le district des 24-Parganas, coextensif à la partie indienne de la grande forêt des Sundarbans, dans le delta du Gange.
Linus Gomes est consacré évêque le , à Calcutta, par le Cardinal Picachy, archevêque de Calcutta. Il établit son siège épiscopal à Baruipur tout en ayant provisoirement sa cathédrale, à Kalyanpur. Des quatre paroisses existant lorsqu’il fut créé le diocèse passe à une dizaine de centres pastoraux. Mgr Gomes promeut les vocations sacerdotales locales, encourage l’éducation et invite plusieurs congrégations religieuses féminines à œuvrer dans son diocèse. Un centre social est créé à Baruipur.
Ayant atteint l’âge canonique de la retraite Mgr Gomes donne sa démission le . Cependant, toujours en bonne santé, il passe encore de nombreuses années au Bangladesh pour y donner des retraites spirituelles aux religieuses du pays. À compter de 2014, il réside dans la communauté jésuite du collège Saint-Xavier de Calcutta.
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