La préfecture apostolique de Fort Johnston (aujourd'hui Mangochi, au Malawi), est créée le 29 mai 1969 par détachement de l'évêché de Zomba.
Elle est érigée en évêché et change de dénomination le 17 septembre 1973 pour devenir l'évêché de Mangochi (Dioecesis Mangociensis).