MCR-1
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Le gène de résistance à la colistine mobilisé (mcr-1, sigle anglais) confère une résistance à la colistine à médiation plasmidique, un des nombreux antibiotiques de dernier recours pour le traitement des infections à Gram négatif. mcr-1 est capable de transfert horizontal entre différentes souches d'une espèce bactérienne. Après sa découverte en dans E. coli (souche SHP45) d'un cochon en Chine, le gène a également été trouvé dans Escherichia coli, Salmonella enterica, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter aerogenes et Enterobacter cloacae. Au moment de 2017, il a été détecté dans plus de 30 pays sur 5 continents en moins d’un an.
Le gène "de résistance mobilisée à la colistine" (mcr-1) confère une résistance à la colistine, une polymyxine et à l'un des nombreux antibiotiques de dernier recours utilisés par les plasmides pour traiter les infections[1],[2]. Le gène est présent chez au moins dix espèces d'entérobactéries : Escherichia coli, Salmonella, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Cronobacter sakazakii, Shigella sonnei, les espèces Kluyvera, Citrobacter, et Raoultella orithinolytica. Le gène mcr-2 est une variante rare de mcr-1 et ne se trouve qu'en Belgique. Des variants supplémentaires, mcr-3, mcr-4 et mcr-5, ont été identifiés dans E. coli et Salmonella[3].
mcr-1 est le premier gène de résistance à la polymyxine connu pour être capable de transfert horizontal entre différentes souches d'une espèce bactérienne[1].
Le mécanisme de résistance du gène MCR est une transférase phosphatidyléthanolamine. L'enzyme transfère un résidu de phosphoéthanolamine au lipide A présent dans la membrane cellulaire des bactéries à Gram négatif. Le lipide A modifié a une affinité beaucoup plus faible pour la colistine et les polymyxines apparentées, ce qui entraîne une activité réduite de l'antimicrobien. Ce type de résistance est appelé modification de cible[4].
Découverte et diffusion géographique
Le gène a été découvert en premier sur E. coli (souche SHP45), en Chine, chez un porc en et publié en [5],[6]. Il a été identifié par des chercheurs indépendants sur des échantillons humains provenant de Malaisie, de Chine[1], d'Angleterre[7],[8], d'Écosse et des États-Unis[9].
En , une femme de 49 ans a demandé des soins médicaux dans une clinique de Pennsylvanie pour des symptômes d'infection urinaire. La PCR d'un isolat d' E. Coli cultivé à partir de son urine a révélé le gène mcr-1 pour la première fois aux États-Unis [10] et le CDC a envoyé une alerte aux établissements de santé. Au cours des douze mois suivants, quatre personnes supplémentaires auraient été infectées par une bactérie porteuse de mcr-1[11].
Au moment de , le mcr-1 a été détecté en moins d'un an dans plus de 30 pays sur 5 continents [12] et il semble se propager dans les hôpitaux en Chine[13]. Entre et , la prévalence dans cinq provinces chinoises était de 15% dans les échantillons de viande crue et de 21% chez les animaux destinés à la consommation humaine pour la période 2011-2014, et de 1% chez les personnes hospitalisées pour infection[1].