Après son bac scientifique et des études hypokhâgne et khâgnes au lycée Thiers à Marseille, elle étudie à l'Institut d'études politiques de Paris. Elle obtient également une licence et une maîtrise de l'histoire de l'art de l'Université de Paris I Panthéon-Sorbonne où elle présente un mémoire sur La représentation de la guerre dans le cycle gravé Der Krieg (1923-1924) d’Otto Dix sous la direction de Catherine Wermester. Ensuite, elle s'inscrit en DEA d'histoire du XXe siècle et soutient un mémoire intitulé Une autre histoire de la guerre du Vietnam : la réhabilitation des anciens combattants du Vietnam à travers les séries télévisées américaines sous la direction de Pierre Mélandri[1]. En 2004, elle est reçue à l'agrégation d'histoire.
Elle soutient sa thèse sur L’identité américaine face à la guerre (1898-1991) : Étude de l’évolution des récits des guerres étrangères dans les manuels d’Histoire des États-Unis à destination du secondaire en 2009, sous la direction de Pierre Mélandri, où elle analyse l'évolution du récit des guerres menées par les États-Unis entre 1898 et 1991 à travers 145 manuels d'Histoire américains publiés entre 1901 et 1991, permettant de comprendre la spécificité et l'évolution de l'identité américaine dans ces récits d'histoire nationale[2].
Elle est maître de conférences en histoire contemporaine à l'Université de Picardie Jules-Verne entre 2010 et 2022 puis professeure des universités en études nord-américaines à l'Université Sorbonne-Paris-Nord depuis 2022[3].
Marjolaine Boutet est consultante historique pour la série Un village français. Elle coprésente avec Mac Lesggy, l'émission L'Histoire au Quotidien sur M6[4].
