Martin Waïngue Bani est né le à Laï au sud du Tchad. Il étudie la philosophie et la théologie au grand séminaire provincial St Augustin de Maroua-Mokolo, au Cameroun de 1985 à 1988. Il complète son parcours de théologie au grand séminaire national Saint Luc de Bakara, à N'Djaména. Il est ordonné prêtre le [1].
Après son ordination, il exerce la fonction de curé de Ngamongo et directeur du Centre catéchétique de Lai entre 1991 et 1995. De 1995 à 1998, il occupe la fonction de recteur du séminaire de saint Augustin dans Bébédji. Par la suite, il fait des études à Rome entre 1998 et 2000, où il obtient une licence en théologie dogmatique à l'université pontificale urbanienne[2].
En 2000, de retour au Tchad, il devient curé de la paroisse cathédrale de Laï dans le diocèse de Doba, fonction qu'il occupe jusqu'en 2004. Dans le même temps il est le vicaire général du diocèse de Laï[3].
Il occupe la fonction de recteur du grand sminaire national de Saint Luc à Bakara près de la capitale du pays N'Djamena, de 2004 à 2010. En 2014, après des études à l'université pontificale urbanienne, il obtient un doctorat en théologie. À partir de 2013, il devient à nouveau vicaire général du diocèse de Laï[3].