En 1670, le duc Gustave-Adolphe de Mecklembourg-Güstrow le nomme au Conseil des affaires ecclésiales et spirituelles. En plus de ce poste, il devient professeur ordinaire de théologie à l'université de Rostock en 1675. En 1678, il devient un évaluateur luthérien strict du consistoire ducal et surintendant du district de l'église de Rostock, mais pas de la ville même.
En 1681, Michael Siricius est rappelé à Güstrow par Gustave-Adolphe tout en conservant son poste de professeur. Il est prédicateur de la cour à Güstrow, mais reste surintendant et évaluateur consistorial à Rostock. En 1684, il est chargé d'interroger le professeur de médecine Sebastian Werdenig sur son traité Nova medicina spirituum de 1673, où il décrit la Rose-Croix.