Mogchok Jampa Tsöndu étudie à l’université monastique de Drepung où il obtient le titre de Guéshé Lharampa puis entre à l’université tantrique de Gyumé. Il construit un nouveau monastère, Silwa Tsel[1], sur le Gönpo Ri, l'une des quatre montagnes sacrés du Tibet central, au-dessus du village de Nyetang, à 20 kilomètres de Lhassa et à proximité du monastère Tashi Detchen construit par le 1er Mogchok Rinpoché, Mogchokpa Rinchèn Tseundru. Ces deux monastères furent détruits durant la révolution culturelle. Silwa Tsel comportait deux statues de 7 mètres de haut représentant Mahakala à six bras et Vajra Yogini ainsi qu'un stupa renfermant les reliques de Jampa Yéshé, et une statue le représentant[2].
Mogchok Rinpoché devint étudiant de Pabongka Rinpoché, passant alors de la tradition Shangpa Kagyu à la tradition Gelugpa[3].
Mogchok Rinpoché enseignait le Lamrim, quand il est mort. Selon une rumeur, à la demande de Khyenrab Norbu, un médecin et astrologue dont il était proche, Mogchok Rinpoché aurait accepté de mourir à la place du dalaï-lama, alors âgé de 13 ans, dont la vie était en danger, selon le médecin-astrologue[4].
Il fut le lama-racine de Rakra Tethong Rinpoché.
Mogchok Rinpoché a été reconnu comme étant sa réincarnation.
