Il poursuit ses études au conservatoire de Téhéran, notamment auprès de Parviz Mahmoud. Il dirige pendant deux ans l'orchestre symphonique de Téhéran dans les années 1950 et fonde dans les années 1960 l'orchestre Fârâbî de la radio de Téhéran.
Parmi les œuvres les plus importantes de Morteza Hannaneh, l'on peut distinguer l'ouverture Hazar-Dastan, la suite Hommage à Ferdowsi pour voix et piano, ainsi que ses nombreuses musiques de films.
