Moussa Toybou, né le , est une personnalité politique comorienne, président, puis gouverneur de l'île autonome d'Anjouan.
À la suite des élections organisées après la destitution de Mohamed Bacar après l'invasion de l'île en , Moussa Toybou remporte en l'élection présidentielle d'Anjouan par 52,42% de voix face à Mohamed Djaanfari[1].
Cet ingénieur qui a été en poste en Algérie bénéficie du soutien du président de l'Union des Comores, Ahmed Abdallah Sambi. Toybou affirme qu'il sait comment « tirer Anjouan du sous-développement » et soutient le fait de permettre à des personnes en place sous Bacar de garder un rôle dans l'administration pour favoriser une réconciliation[2]
À la suite du référendum constitutionnel de 2009[3], qui transforme la fonction de président des îles en gouverneurs élus en même temps que le président de l'Union, puis la décision de la Cour constitutionnelle[4] fixant la date du scrutin à 2010, Moussa Toybou se représente deux ans après son élection. Au second tour, il est opposé à Anissi Chamsidine[5].
il est accusé d’être le commanditaire de l'assassinat de Monsieur Salim ABDALLAH M'CHIDRA, survenu le . ce dernier étant un opposant au pouvoir.