Natsu Nakajima est née en 1943 à Sakhaline. Cette île, située dans le nord-ouest de l'océan Pacifique, est alors occupée par le Japon : ce territoire russe a été plusieurs fois déclaré également chinois ou japonais au fil des siècles[2].
En 1955, elle commence à étudier le ballet classique. Elle entre à l'Institut de danse d’Ohno Kazuo en 1962. Contrairement à son mentor Tatsumi Hijikata, elle effectue de nombreuses tournées à l'extérieur du Japon. En particulier, le succès rencontré en 1983 au London International Festival of Theatre (LIFT) par son œuvre Niwa, l'amène à se produire dans différents festivals, sur plusieurs continents, notamment à Montréal, Jérusalem, Los Angeles, Nancy et Sydney[3]. Elle devient ainsi non seulement l'une des premières danseuses de butoh, mais aussi l'une des premières, avec Ohno Kazuo, à présenter cette forme au public étranger[4]. Elle dirige et chorégraphie le groupe Muteki-sha, une compagnie de danse qu’elle fonde en 1969[2],[5].
Elle joue dans des films et des productions théâtrales, notamment dans le film Jeux sexuels (性遊戯?) de Masao Adachi en 1968. Elle y interprète le rôle d’une jeune femme, Taeko, agressée par un groupe de jeunes hommes[6]. Elle apparaît également dans le documentaire Butoh: Body on the Edge of Crisis sorti en 1990[7]. Elle intervient également dans un autre film documentaire sorti en 2011, Interior/Exterior. Ce documentaire présente un aperçu de la pensée esthétique japonaise contemporaine, du point de vue de onze artistes japonais.