Il était arrière-petit-fils de Luis de Zúñiga y Requesens. Il s'est marié en premières noces avec Ana Girón Enríquez de Ribera, dont il a eu un fils: Luis Francisco Fajardo, premier marquis de Martorell (né en 1637 et décédé jeune)[1]. En secondes noces, il a épousé María Engracia de Toledo y Portugal qui est morte en 1696 et dont il a eu 4 enfants:
En 1640, Gaspar de Guzmán y Pimentel, le comte-duc d'Olivares l'a nommé Vice-roi de Catalogne et chef de l'armée de Philippe IV qui a envahi la Catalogne pour la récupérer, contre les institutions catalanes dirigées par le président de la GénéralitéPau Claris en 1641 (Guerre des faucheurs ou de Séparation de la Catalogne). Ces institutions avaient recherché l'appui militaire et politique de la monarchie française. L'armée castillane, avec de nombreuses troupes auxiliaires d'autres nationalités (portugais, italiens, etc.), après avoir avancé avec succès sur Tortosa et Tarragone et avoir réprimé la résistance par des actes de cruauté, a été battue lors de la tentative d'assaut de la cité de Barcelone dans la Bataille de Montjuïc le . Cette défaite lui a coûté sa place. Il a été remplacé par Federico Colonna.
Envoyé comme ambassadeur à Rome, il a été nommé vice-roi de Sicile en 1644, où il a dû réprimer la révolte des Palermitains menés par Nino La Pilosa en mai 1647. Il a fui temporairement à Messine, laissant les maestranze diriger la ville et Giuseppe D'Alesi mener une nouvelle émeute. Attaqué dans le Palais royal, Los Velez a fui à nouveau. Affaibli, prostré, il est mort à Palerme le suivant[2].