Pema Choden est diplômée du Sherubtse College de Kanglung au Bhoutan. Elle étudie ensuite à l'étranger, en France, où elle devient titulaire d’un diplôme en relations internationales de l’Institut international d’administration publique (IIAP), intégré à l’École nationale d’administration (ENA) à Paris.
Pema Choden rejoint le ministère des Affaires étrangères et du Commerce extérieur en 1989. Elle y occupe divers postes, notamment cheffe de la Division de la politique et de la planification, cheffe de la Division Europe, Amériques et Afrique au sein du département des affaires bilatérales, directrice adjointe de la Division bilatérale, attachée dans la division bilatérale et multilatérale[1].
Elle a ensuite servi à la Mission permanente du Bhoutan auprès des Nations unies à Genève et à l’ambassade du Bhoutan à Dacca.
De 2007 à 2011, elle est détachée au poste de directrice générale de la Bhutan Broadcasting Service Corporation à Thimphou.
D’avril 2014 à mars 2016, elle est ambassadrice du Bhoutan au Bangladesh, avec accréditation concurrente auprès des Maldives, du Pakistan, de la Corée du Sud et du Sri Lanka.
De 2016 à janvier 2021, elle est ambassadrice du Bhoutan auprès de la Belgique et de l’Union européenne, avec accréditation concurrente auprès de la Suède, des Pays-Bas, du Danemark, de la Finlande et de l’Espagne[2].
En mars 2021, elle est nommée directrice générale du département des affaires multilatérales, puis, le 6 novembre 2021, secrétaire aux Affaires étrangères du Bhoutan.
Elle est mariée et mère de trois enfants.
