La réserve naturelle des îles Selvagens est la plus ancienne réserve naturelle portugaise. La construction du phare et la présence des gardiens de phare est une étape importante dans l'histoire de cette réserve. Selon l'histoire, c'est en 1881 que l'idée de la construction d'un phare dans les îles Selvagens est apparue. Mais la souveraineté des îles entre le Portugal et l'Espagne n'était pas encore réglée. En raison du manque réciproque de compréhension, la construction du phare a été longtemps différée. C'est en 1938 que la Commission permanente du droit maritime international a certifié la souveraineté des îles pour le Portugal et a fait placer un point de repère astronomique sur Selvagem Grande par la Mission hydrographique des îles adjacentes[2] cette même année. Le besoin d'un phare aux îles Selvagens a été mis d'actualité après plusieurs naufrages à cause de l'absence de signalisation des bancs rocheux à l'approche des îles. La responsabilité du Portugal, en matière de sécurité maritime dans les îles Selvagens, a été remise en cause après ces nombreux naufrages.
Le premier phare a été mis en service le , au Pico da Atalaia sur Selvagem Grande et le second le de la même année au Pico do Veado sur Selvagem Pequena. La modernisation des phares du Portugal a fait que les phares des îles Selvagens ont été les premiers à utiliser des cellules photovoltaïques pour l'alimentation de leur feu.
Le phare de Selvagem Pequena est installé au sommet du Pico do Veado, le point culminant de l'île, au nord de celle-ci. Le feu est monté sur une colonne de béton de seulement 1 mètre de haut, pour résister aux intempéries. Il émet, à 50 m au dessus-du niveau de la mer, deux éclats blancs toutes les 6 secondes, visibles jusqu'à 22 km.
