Psychrobacter
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Psychrobacter est un genre de bactérie appartenant à la classe des Gammaproteobacteria, à coloration de Gram négatif, aérobie strict, chimiohétérotrophe, adapté au froid et osmotolérant. Les cellules sont sphériques à bacillaires[1].
Le genre Psychrobacter est trouvé dans une large gamme d’habitat. Un grand nombre d’espèces étudiées sont isolées d'environnements froids et salins (eau de mer glaciale, pergélisol) et d’environnements marins plus conventionnels (eau de mer, sédiment marin, marais salant). Certaines espèces font partie de microbiomes alimentaires : poisson salé, poisson frais, fruits de mer fermentés, fromages. Certaines peuvent altérer les aliments.
Description de quelques espèces
- Psychrobacter immobilis : cette espèce est isolée de l'eau de mer, de poissons et de viandes. Elle peut être impliquée dans l'altération de produits alimentaires. Elle est aussi parfois isolée d'échantillons cliniques (abcès, plaies, LCR, cathéters…).
- Psychrobacter fozii est isolée de sédiments marins et d'eau de mer.
- Psychrobacter frigidicola a été isolée du sol de l'Antarctique.
- Psychrobacter pacifiensis a été isolée de l'Océan, à 6 000 m de profondeur.
- Psychrobacter phenylpyruvicus est isolée de l'appareil urogénital ou de l'intestin des mammifères.
- Psychrobacter pulmonis a été reconnue comme pathogène (isolée de poumons d'agneaux).
Souche ancienne
Une Psychrobacter ancienne (souche SC65A.3), proche de Psychrobacter cryohalolentis (en), a été décongelée de glaces âgées d'environ 5 000 ans dans la grotte de Scărișoara en Roumanie. Elle est remarquable pour être résistante à une dizaine d'antibiotiques actuels appartenant à 8 familles distinctes (incluant des céphalosporines de troisième génération, des aminoglycosides, des fluoroquinolones et la rifampicine), ce qui témoigne de l'apparition de résistances non anthropiques (antérieures à la pharmacopée moderne). Elle dispose des gènes ampC, gyrA, tetA, tetC et mcr-1[2].
Liste d'espèces
- Psychrobacter adeliensis Shivaji & al., 2005
- Psychrobacter aestuarii Baik & al., 2010
- Psychrobacter alimentarius Yoon & al., 2005
- Psychrobacter aquaticus Shivaji & al., 2005
- Psychrobacter aquimaris Yoon & al., 2005
- Psychrobacter arcticus Bakermans & al., 2006
- Psychrobacter arenosus Romanenko & al., 2004
- Psychrobacter celer Yoon & al., 2005
- Psychrobacter cibarius Jung & al., 2005
- Psychrobacter cryohalolentis Bakermans & al., 2006
- Psychrobacter faecalis Kämpfer & al., 2002 emend. Deschaght & al., 2012
- Psychrobacter fozii Bozal & al., 2003
- Psychrobacter frigidicola Bowman & al., 1996
- Psychrobacter fulvigenes Romanenko & al., 2009
- Psychrobacter glacincola Bowman & al., 1997
- Psychrobacter immobilis Juni & Heym, 1986
- Psychrobacter jeotgali Yoon & al., 2003
- Psychrobacter luti Bozal & al., 2003
- Psychrobacter lutiphocae Yassin & Busse, 2009
- Psychrobacter marincola Romanenko & al., 2002
- Psychrobacter maritimus Romanenko & al., 2004
- Psychrobacter namhaensis Yoon & al., 2005
- Psychrobacter nivimaris Heuchert & al., 2004
- Psychrobacter okhotskensis Yumoto & al., 2003
- Psychrobacter pacificensis Maruyama & al., 2000
- Psychrobacter phenylpyruvicus (Bøvre & Henriksen, 1967) Bowman & al., 1996
- Psychrobacter piscatorii Yumoto & al., 2010
- Psychrobacter proteolyticus Denner & al., 2001
- Psychrobacter pulmonis Vela & al., 2003
- Psychrobacter salsus Shivaji & al., 2005
- Psychrobacter sanguinis Wirth & al., 2012
- Psychrobacter submarinus Romanenko & al., 2002
- Psychrobacter urativorans Bowman & al., 1996
- Psychrobacter vallis Shivaji & al., 2005
Utilisation
Certaines souches présentent un intérêt biotechnologique comme la production de protéines et enzymes actives à des températures froides (pour des modifications de substances thermolabiles par exemple).