Rex (protéine)
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La protéine Rex est une protéine virale du virus T-lymphotrope humain de type I et 2 (HTLV-I/II).
Le virus HTLV-1 est un rétrovirus appartenant à la famille des Oncornavirinae.
Il est le premier rétrovirus oncogène découvert chez l'homme en 1980 par l'équipe du Dr Gallo à partir d'une culture de cellule T. Il est de la même famille que le VIH (famille des rétroviridae) dont son homologue chez ce dernier est Rev.
Son génome est constitué de deux séquences LTR en 5’ et 3’ séparées par les régions Gag, Pol, Env, codant les protéines de structure et la transcriptase inverse, et la région Px codant des protéines favorisant la transformation tumorale de la cellule hôte, en particulier des lymphocytes T.
Structure
La protéine Rex est une phosphoprotéine nucléolaire de 189 acides aminés qui provient d’un épissage alternatif du gène codant également une autre protéine Tax. Ces deux protéines sont codées par un seul ARNm qui provient de deux épissages du transcrit primaire et contient deux codons d'initiation déphasés, d'abord celui de Rex, puis celui de Tax. La région 5' non traduite de cet ARNm contient deux GUG en phase avec l'AUG de Rex et deux CUG en phase avec l'AUG de Tax. La structure particulière de cet ARNm requiert l'existence d'un contrôle de la synthèse de Rex et de Tax par une sélection des codons initiateurs AUG et de tout ou partie des GUG et CUG. Par mutagenèse dirigée, il a été démontré que, en plus des deux AUG, les deux GUG et le second CUG sont utilisés comme codons d'initiation de la traduction d'ARNm chimériques qui contiennent la séquence codante de CAT en aval et en phase avec soit l'AUG de Rex, soit celui de Tax. Ces mêmes initiations de la traduction conduisent probablement à la synthèse d'isoformes de Rex et de Tax, détectées dans des cellules chroniquement infectées par HTLV-I. La synthèse de Tax requiert une initiation de la traduction dépendante de la coiffe car elle est inhibée (1) par l'insertion d'un AUG en amont de l'AUG de Tax et (2) par la protéase 2A (de poliovirus) qui coupe le facteur eIF-4G indispensable à une telle initiation. La synthèse de Rex n'est pas modifiée par l'insertion d'un AUG en amont de l'AUG de Rex et peut être maintenue en présence de la protéase 2A, à condition que Rex soit apportée en trans. L'intégrité de la séquence NH[2]-terminale de Rex, qui contient le domaine de liaison aux ARN, est indispensable à cette activité, comme l'est l'élément de réponse de Rex (XRE) sur l'ARN. Ainsi Rex, en interagissant avec le XRE, contrôlerait sa propre synthèse en permettant une initiation de la traduction indépendante de la coiffe.
