Il étudie l’histoire de l'art et les belles-lettres à l'université de Vienne à partir de 1945, obtient un doctorat en 1949 et rejoint le service de la ville de Vienne[2].
De 1959 à 1974 , il est conseiller aux affaires culturelles du Grand-Vienne. Sur la recommandation de Gertrude Fröhlich-Sandner, il est nommé en 1974 conservateur en chef des musées de Vienne. Comme l'indique l'Aeiou-Österreich-Lexikon, il a, au gré d'importantes expositions (hommages à Wolfgang Amadeus Mozart, Joseph Haydn, Ludwig van Beethoven, Adalbert Stifter), fait du musée historique de la ville de Vienne un établissement de rayonnement international[3]. Parmi les manifestations marquantes organisées sous son mandat, il y a lieu de mentionner Traum und Wirklichkeit. Wien 1870–1930 (hiver 1984-85) à la Künstlerhaus, sur une scénographie d'Hans Hollein, qui a attiré plus de 600 000 visiteurs[4]. Waissenberger a milité pour l'ouverture du Musée viennois du Judaïsme et a exercé les fonctions de président de l'Association des musées autrichiens de 1984 à 1987. Nommé conseiller d'Etat en 1977 et conseiller ad honorem de la ville de Vienne en 1987, il a reçu en 1986 la Croix d'honneur des Sciences et de la Culture.