SOAPdenovo
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SOAPdenovo est un logiciel d'assemblage de novo de courtes séquences d'ADN produites par un séquenceur de gènes [1]. Cet outil fait partie de la suite logicielle SOAP (Short Oligonucleotide Analysis Package)[2].
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SOAPdenovo
| Développé par | Institut de génomique de Pékin |
|---|---|
| Dernière version | r240 |
| Environnement | UNIX (Linux, Mac OS X) |
| Type | Bio-informatique |
| Licence | GPL version 3.0 |
| Site web |
Historique
SOAPdenovo a été développé en 2009 par l'Institut de génomique de Pékin. Ce logiciel a été utilisé pour la première fois dans un projet visant à assembler de novo la séquence du génome humain, et ce, de manière rapide et économique[3]. Le même logiciel fut utilisé un an plus tard pour assembler, de la même façon, le génome du panda géant[4].
