De 1950 à 1954, il suit un apprentissage de tailleur de pierre dans l'entreprise de son père et fréquente la Kunstgewerbeschule de Berne. En 1954, il s'installe à Munich et y étudie auprès de Charles Crodel ou Josef Henselmann jusqu'en 1961 à l'Académie des beaux-arts. En 1961, il s'installe dans le canton de Soleure, où il vit principalement à Küttigkofen. En 1969 et 1970, il fait un séjour à Varsovie.
De 1982 à 1985, il vit à Hambourg et de 1985 à 1987 à Berlin. Il déménage alors à Hessigkofen. En collaboration avec les architectes bernois Ueli Schweizer et Walter Hunziker et l'architecte paysagiste bernois Franz Vogel, il conçoit une extension du cimetière de Bümpliz, achevée en 1994.
Le , Hutter installe sa sculpture de fer Shoah devant le Palais fédéral à Berne dans le cadre d'un parcours de sculptures à l'occasion du 200eanniversaire de la République helvétique. Comme elle fut posée à trois mètres de l'endroit initialement convenu, elle est enlevée le après une plainte du Parti suisse de la liberté et amenée à l'atelier de l'artiste. La sculpture est ensuite exposée à Zurich, Bâle, Aarau, Soleure et Glaris et est maintenant à Langenthal.
À partir de 1999, Hutter vit à Gênes, avec une résidence sporadique en Suisse à Derendingen. Il meurt à Soleure en 2021.
À l'occasion de son 80eanniversaire, une grande exposition anniversaire a eu lieu au Tramdepot Burgernziel à Berne du au .
